棋钟礼仪在第一步之前就应该约定好。双方先确定时限、谁先走、各自点击哪一侧、误触如何处理，以及谁可以要求暂停。之后每一步都遵守同一套流程。1Chess Clock提供棋钟控件，但不能替代组织者的规则，也不会自动替双方裁决争议。
开局前约定流程
把手机放在双方都能看清两侧面板、也能够到自己一侧的位置。一起读出初始时间和每步规则。双方各试走一步，确认每个人应该点击哪一侧。如果使用 Fischer 加秒或 Bronstein 延时，应在开局前确认模式；常见时限设置指南集中说明了几个例子。
还要提前约定漏点、连续点击或对显示有疑问时怎么处理。友谊赛可以当场协商修正；俱乐部或正式活动则应遵守组织者或裁判的处理方式。不要因为一方正在掉时间，就在对局中途临时制定新规则。
一般礼仪与正式规则
基本做法很简单：走完一步后点击棋钟，移开手，让对手继续。不要把手悬在控件上，不要点击对手一侧，也不要在对局进行时打开设置。正式棋局的棋钟操作和棋手责任见FIDE Laws of Chess 第 6 条。需要判定时，应以该来源和活动规则为准；本页只是应用操作清单，不能替代裁判。
应用的大号面板方便快速交接，但礼仪不变。等界面显示对手一侧已经活动后再继续走棋，这样手机不会在棋盘旁制造歧义。
操作 1Chess Clock
走完后点击自己这一侧。己方时间停止，对手一侧开始计时。如果点击没有生效或连续点了两次，先停下来，按开局前的约定处理。不要在棋钟运行时修改时限来“修复”问题。1Chess Clock 入门说明基本操作。
临时停局时使用中央暂停。暂停会保留当前会话，重置则返回所选的初始设置，两者不是一回事。暂停与重置指南详细说明了区别。
在双方同意后暂停或重置
说明暂停原因，使用中央控件处理暂时中断，并在继续前确认哪一方处于活动状态。只有对局结束、弃局，或双方明确同意重新开始时才重置。在俱乐部中应把流程写下来，让教练、家长或裁判能够一致执行；俱乐部和教练棋钟指南补充了准备方式。